中醫學系統的核心就是「中醫哲學」理論。它重點研究的思維規律和哲學範疇又是什麼，它在中醫學中是如何體現的，今天就來說一說。
在古代，當中醫學在開始構建自身學術理論之初，已非常重視氣學說的引入和運用。根據《左傳?昭公元年》所載，早在春秋時期的醫和，已經運用「六氣」的概念說明病因病機。而戰國時期的名醫扁鵲亦在其醫事活動中使用「血氣」、「氣閉」等術語。作為中醫理論體系的奠基著作《黃帝內經》更是全面引入先秦哲學中的精氣學說，並結合醫學內容，形成具有獨特內涵的中醫氣學學說。
有人曾經統計，《黃帝內經》全書162篇，有150篇論到氣的內容，所載各種「氣」的名稱共有2997個。內容覆蓋陰陽五行、臟腑經絡、病因病機、診法、治則治法及養生等各個方面。比如：陰氣、陽氣、宗氣、真氣、經氣、營氣、衛氣等。來源是先秦哲學精氣學說，但在認識生命、指導臨床實踐之中，又形成了醫學自身獨特的又有鮮明個性內涵的醫學理論。
中醫學「氣」的內容主要有：
第一，?重研究的是人體之氣，在認同氣是生命本原的同時，更強調氣是生命活力之源。古代哲學所講的元氣是充盈在宇宙之間，化生天地萬物的無形本體。而中醫所言的元氣，則為人身諸氣的一種，它既是生命的本原物質，更是完成生命活動的原動力。
第二，中醫學在研究生命活動機制時，則把氣視為物質與功能的統一體，以氣的運動變化來說明生命的動態過程，既重視氣的物質性，更看重它的功能性的研究。
第三，中醫學從生命活動出發，對各種氣作出具體的劃分區別和命名，賦予其在醫學上特有的含義。
第四，古代哲學之氣論，重視其宇宙本體的含義，而中醫學論氣，雖然也認其為無形物質，重視氣的功能活動，但也善於從各種生理、病理、症狀和服藥、針灸、推拿、氣功等治療後的反應中去認識氣的狀態，運動變化，使人體各種氣顯得各有象徵性。
第五，在氣化的運動方面，中醫學將氣化活動的過程，視為人體生命活體存在的必要條件，並提出了「氣機」這一概念，且以氣機的升降運動來解釋人體複雜的生理、病理現象。
中醫學中有關氣的學說，它脫胎於古代哲學氣論的學說，但結合自身的醫學內容，形成了自己醫學的氣論學說。用它來闡明中醫學中有關人體各種複雜的生理現象、病理反應，成為中醫學基礎理論之一。
